El museu diocesà s’ubica a les dependències del convent de Sant Agustí, també conegut com el Socors. El conjunt actual es va aixecar al segle XVII, tot i que al segle XV ja es documenta l’existència d’una construcció conventual a Ciutadella, molt malmesa pels atacs dels turcs (1558). Després de la desamortització, la seva església, en la qual destaquen els frescos de la volta, va passar a mans del seminari. Després de la destrucció causada per la Guerra Civil, es va decidir utilitzar-la com a seu del Museu Diocesà.

El museu conté peces relacionades amb l’illa, com ara material arqueològic, pintures i gravats dels segles XVIII i XIX, obres del pintor menorquí Pere Daura (1896-1976) i col·leccions procedents del Gabinet de Ciències Naturals i Física del Seminari Diocesà.

Avui a la resta del convent hi conviuen diversos usos. Una ala està reservada a la comunitat religiosa, però la resta està oberta al públic. Per aquest motiu, és possible utilitzar la biblioteca i les sales de reunions, i fins i tot allotjar-s’hi. A més, s’ofereixen visites guiades per contemplar els espais més rellevants de la construcció, com el claustre. Puntualment s’hi organitzen concerts.